3.5 yıldır TÜBİTAK Başkanlığı yapan Prof. Altunbaşak, istifasını Bilim, Sanayi ve Teknoloji Bakanı Fikri Işık'a sundu. İstifayı işleme koyan Bakan Işık'ın Başbakanlığa ve Cumhurbaşkanlığına istifa hakkında bilgi verdiği öğrenildi. TÜBİTAK, kriptolu telefonların yasadışı olarak dinlenilmesi, böcek raporu, Balyoz, Poyrazköy ve kozmik oda davalarında uzmanlarının hazırladığı raporların yargı organları tarafından şaibeli bulunması ile ilgili çeşitli skandallara imza atmıştı.